टमाटर ब्राउन रुगोज फ्रुट भाइरसले विश्वभर टमाटर र काली मिर्चको बोटलाई संक्रमित गर्ने क्रममा बीउ कम्पनीहरूले प्रतिरोधी टमाटरको प्रजननमा काम गरिरहेका छन्।
टमाटरको जीनोमिक सिक्वेन्सिङ परियोजनाहरू सुरु हुनु अघि नै टमाटर प्रजनकहरूलाई धनी आनुवंशिक र जीनोमिक स्रोतहरू उपलब्ध थिए। ठूला टमाटर जर्मप्लाज्म संग्रहहरू लामो समयदेखि धेरै स्थानहरूमा स्थापना भएका छन्। विश्वभरका जीनबैंकहरूमा ७५,००० भन्दा बढी टमाटर एक्सेसन्स सुरक्षित छन्। सबैभन्दा ठूलो मध्ये एक जेनेभा, NY मा USDA genebank हो।
टमाटर जीनोमको अनुक्रमण 2005 मा 14 देशहरू बीच बहुराष्ट्रिय प्रयासको रूपमा सुरु गरिएको थियो र 2012 मा पूरा भयो। यी प्रयासहरूलाई ठूलो मात्रामा आनुवंशिक र फेनोटाइपिक डेटाको विश्लेषण गर्न कृत्रिम बुद्धिमत्ता, मेशिन लर्निङ र उन्नत एल्गोरिदमको प्रयोगको साथमा तीव्रता दिइएको छ।
टमाटर प्यान-जीनोम
2020 मा Boyce Thompson संस्थानका अन्वेषकहरूले थप पूर्ण र उपयोगी टमाटर प्यान-जीनोम उत्पादन गर्न जंगली टमाटरहरूको लागि उच्च-गुणस्तरको सन्दर्भ जीनोम सिर्जना गरे। तिनीहरूले फलफूलको स्वाद, आकार र पकाउने, तनाव सहनशीलता र रोग प्रतिरोधात्मक क्षमतालाई निहित गर्ने जीनोमका खण्डहरू पत्ता लगाए। DNA को धेरै लामो टुक्राहरू पढ्न सक्ने अत्याधुनिक सिक्वेन्सिङ टेक्नोलोजीहरूको लागि धन्यवाद, सन्दर्भ जीनोम अवस्थित डाटाबेस भन्दा बढी पूर्ण र सही छ।
DNA को छोटो टुक्राहरू पढ्ने पुरानो अनुक्रमण प्रविधिहरूले एकल-आधार स्तरमा उत्परिवर्तनहरू पहिचान गर्दछ। यद्यपि, तिनीहरू संरचनात्मक भेरियन्टहरू फेला पार्नमा राम्रो छैनन् जस्तै सम्मिलन, मेटाउने, उल्टो वा DNA को ठूलो भागको नक्कलहरू।
2019 मा, अन्वेषकहरूको एक अन्तर्राष्ट्रिय समूहले 725 फाइलोजेनेटिक र भौगोलिक रूपमा प्रतिनिधि प्रजातिहरूबाट जीनोम अनुक्रमहरू प्रयोग गरेर टमाटर प्यान-जीनोम निर्माण गर्यो। यो डाटाबेसले 4,873 जीनहरू समावेश गर्दछ जुन मूल सन्दर्भ जीनोममा फेला परेन। वर्तमान/अनुपस्थित भिन्नता विश्लेषणहरूले टमाटरको घरपालन र सुधारको क्रममा जीन र प्रवर्द्धकहरूको पर्याप्त जीन हानि र तीव्र नकारात्मक चयन प्रकट गरेको छ।
www.seedworld.com मा पूरा लेख पढ्नुहोस्।